一、RAPD技术在羊遗传育种中的应用（论文文献综述）
白瑞霞[1]（2008）在《枣种质资源遗传多样性的分子评价及其核心种质的构建》文中指出枣是原产我国的重要果树,种质资源极其丰富,遗传背景复杂。枣种质资源的研究涉及形态学、孢粉学、生物化学、分子生物学等领域,经历了从形态多样性到DNA多样性的发展过程。由于缺乏系统研究,对枣种质资源的亲缘演化关系目前仍不很清楚,尤其在核心种质构建方面的研究几乎为空白。本研究应用AFLP和SRAP分子标记技术对177份枣种质资源的亲缘关系、遗传多样性进行了分析,构建了枣的核心种质,为枣的分类、遗传育种和种质资源保存提供了有力证据,主要研究结果如下:1.确定了适合AFLP分析的枣基因组DNA提取方法为改良CTAB法,在细胞核裂解之前,用CTAB-free缓冲液对叶片组织匀浆洗涤后再进行DNA提取,可有效克服多糖等次生代谢物质对提取的干扰;加大CTAB浓度,用3×CTAB作为裂解液;在用无水乙醇沉淀DNA之前,用高浓度NaCl再次分离多糖。粗提后的DNA经RNase处理去除RNA,氯仿/异戊醇抽提去除蛋白质,得到了基本无降解、无污染、高分子量的枣基因组DNA。2.从120对AFLP引物组合中选出17对谱带清晰、多态性高的引物组合。对177份枣种质资源进行扩增分析,共扩增出577条电泳谱带,平均每对引物产生34条谱带,其中372条为多态性带,多态性比率为64.47%;其余205条谱带为所有材料共有,占35.53%。供试样品间的遗传相似系数在0.761～1.000之间。圆铃与酥圆铃之间遗传相似系数最大,为1.000;秤砣枣与酸枣1之间的遗传相似系数最小,为0.761。3.构建了供试材料的AFLP指纹图谱,部分供试材料具有独有的特征带,其余材料可通过二歧分类法确定各自在AFLP图谱中的差异带,根据样品的特征带或差异带可区分开所有的供试材料。4.利用6对SRAP引物组合对177份枣种质进行扩增,共扩增出113条谱带,平均每对引物能扩增出19条谱带。其中51条带为所有材料共有,占45.13%;其余62条均为多态性带,多态性检出率为54.87%。供试样品间的遗传相似系数范围在0.727～1.000之间。圆铃与酥圆铃,无头枣与襄汾圆枣,义乌大枣与南京枣,壶瓶酸与壶瓶枣,大马牙与葫芦长红,金丝小枣与金丝蜜,赞新大枣、赞皇大枣1与赞皇大枣2之间遗传相似系数最大,均为1.000;新疆小圆枣与永城长红,小平顶与核桃纹,小木枣与短果长红之间的遗传相似系数最小,均为0.727。5.采用UPGMA法对供试材料的AFLP数据、SRAP数据和AFLP与SRAP整合数据进行聚类分析,聚类结果与枣种质地理来源关系密切。6.基于AFLP和SRAP分析结果,在分子水平上,探讨了几组枣品种的亲缘演化关系:（1）酥圆铃与圆铃可能是同物异名;老婆枣可能是由核桃纹演化而来;延川狗头枣与圆铃的亲缘关系较近。（2）磨盘枣与圆铃枣品种群的亲缘关系较近,是由圆铃枣演化而来。（3）宣城尖枣、义乌大枣与南京枣亲缘关系较近,推测为同一近缘系。（4）宁阳六月鲜、孔府酥脆枣和疙瘩脆亲缘关系较近,推测为同一近缘系。（5）葫芦长红与大马牙的亲缘关系极近;短果长红与其他长红枣品种群的品种的亲缘关系稍远。河南龙枣与河北龙枣亲缘关系极近,推测为同一近缘系,是由长红枣演化而来;串铃与长红枣的亲缘关系较远,并不属于长红枣品种群。（6）大名布袋枣与尜尜枣亲缘关系较近,推测为同一近缘系。（7）金丝小枣品系间的差异是DNA水平的差异;天津快枣、二秋枣、缨络枣、郎家园枣、长木枣、小木枣、马铃脆和金丝小枣的关系较近,是金丝小枣品种群的组成部分;无核小枣是由金丝小枣演化而来。（8）馒头枣、沧县傻枣、大白铃、大瓜枣、大荔鸡蛋枣、溆浦鸡蛋枣、涪陵鸡蛋枣与临猗梨枣具有较近的亲缘关系,推测它们为同一近缘系。（9）敦煌大枣和临泽大枣亲缘关系极近,推测为同一近缘系。（10）临泽小枣和中宁小枣亲缘关系极近,推测为同一近缘系。（11）大王枣、薛城冬枣和雪枣的亲缘关系较近。（12）赞皇大枣株系间的差异是DNA水平的差异。（13）婆枣株系间的变异程度较大;泡泡红、串干、沙枣与婆枣的亲缘关系较近,可能为同一近缘系。（14）灵宝大枣和屯屯枣的亲缘关系较近,差异应该属于品种内株系间的差异。（15）小平顶和朝阳圆枣的亲缘关系较近,为同一近缘系。（16）胎里红和三变红的亲缘关系较远,并不是同一个品种。（17）蒲城晋枣和耙齿枣的亲缘关系较近,可能为同一近缘系。（18）稷山圆枣和柳罐枣的亲缘关系较近,可能为同一近缘系。（19）茶壶枣与扁核酸的亲缘关系较近,推测茶壶枣可能是由扁核酸变异而来。（20）日出、红颜和福枣3个韩国品种与中国枣品种亲缘关系较近,3个品种之间的遗传差异较大。7.根据AFLP和SRAP数据整合后的聚类结果,对166个枣品种采用3种方法构建核心种质,比较了等位基因数、有效等位基因数、Nei’s遗传多样性指数和Shannon’s信息指数,表明采用逐步聚类法构建的枣核心种质代表性较好。枣核心种质包括50份资源,观测等位基因数、有效等位基因数、Nei’s遗传多样性指数和Shannon’s信息指数的保留率基本在95%以上,核心种质能很好的代表初始种质。
彭礼繁,罗光彬,陈浩杰[2]（2007）在《RAPD技术在动物育种上的应用》文中研究表明RAPD技术自1990年创立以来得到了广泛的应用,但其重复性差,多态性低和成本较高等缺点始终是应用中较大的制约因素。近年来,RAPD技术在模板DNA获得方面有一定进展,并通过改变反应条件和检测手段提高了结果的多态性和可重复性。本文综述了RAPD技术的原理、研究进展,并探讨了RAPD技术存在的问题、完善方法及应用前景。
彭礼繁,罗光彬,陈浩杰[3]（2007）在《RAPD技术在猪育种上的应用》文中研究指明RAPD技术自1990年创立以来得到了广泛的应用,但其重复性差,多态性低和成本较高等缺点始终是应用中较大的制约因素。近年来,RAPD技术在模板DNA获得方面有一定进展,并通过改变反应条件和检测手段提高了结果的多态性和可重复性。本文综述了RAPD技术的原理、研究进展,并探讨了RAPD技术在猪育种上的应用存在的问题、完善方法及应用前景。
徐崇志,廖胜刚[4]（2006）在《分子标记技术在果树种质资源及遗传育种研究中的应用》文中指出本文就果树上常用的DNA分子标记的原理和特点进行了介绍,并对其在果树的种质资源、遗传育种研究中的种质资源的保存、品种鉴定、亲缘关系的演化及分类、遗传多样性分析、系谱分析、分子遗传图谱的构建、基因的定位、基因克隆、分子标记辅助选择育种等方面关于分子标记技术的应用进行了综述。
马巍[5]（2006）在《中国主要山羊品种RAMP标记多态性的研究》文中研究指明应用OFDA2000型羊毛羊绒纤维直径快速检测仪，对吉林省镇南种羊场新吉细毛羊种群、双辽种羊场东北细毛羊种群羊毛纤维品质进行检测，并统计分析。结果表明：1．镇南种羊场新吉细毛羊种群、双辽种羊场东北细毛羊种群羊毛纤维平均直径分别为（20.28±1.72）μm、（20.29±1.77）μm，镇南种羊场新吉细毛羊种群纤维平均直径略细于双辽种羊场东北细毛羊种群，但差异不显着（P＞0.05）；2．羊毛纤维伸直长度分别为（12.32±1.75）cm、（11.29±1.82）cm，且差异极显着（P＜0.01）；3．自然长度分别为（8.12±1.39）cm、（6.78±1.96）cm，且差异极显着（P＜0.01）；4．净毛率分别为（57.58±6.79）％、（48.65±11.22）％，且差异极显着（P＜0.01）；5．两种群羊毛纤维单位长度平均弯曲数均在4个以上，但两种群差异不显着（P＞0.05）；6．各性状之间存在一定的相关关系，其中产毛量与羊毛纤维伸直长度、自然长度与伸直长度之间存在极显着正相关（P＜0.01）。 为进一步了解两种群羊毛品质及遗传特点，本研究应用40条随机引物分别对20只成年新吉细毛羊和20只成年东北细毛羊全血基因组DNA进行随机扩增，并利用SPSS11.5对其多态性进行方差分析和T检验。结果表明：筛选出的12条引物均不同程度地产生了多态性片段，扩增片段的碱基数一般都在300-3000bp之间。同一引物同一条带在2种群中出现频率不同。引物f21326在2种群中出现特异带（973bp），推断此带为东北细毛羊种群所特有。另外，新吉细毛羊品种内平均带纹相似性指数比东北细毛羊低，而2品种之间的遗传距离又较小。同时，发现一些与产毛性状及体重紧密相关的RAPD标记。新吉细毛羊基因组DNA多态频率为54.32％，多态标记f21344A、f21326G、f21339C、g2742C与产毛性状及体重呈显着（P＜0.05）或极显着（P＜0.01）相关；东北细毛羊基因组DNA多态频率为52.08％，多态标记f21328E、f21326A、f21327F、g2739C与产毛性状及体重呈显着（P＜0.05）或极显着（P＜0.01）相关。
李力[6]（2006）在《四川各地黑山羊分子遗传特征研究》文中进行了进一步梳理黑山羊主要产于我国的南方及东南亚，久负盛誉。其独特之处在于全身黑毛，生长发育快，板皮厚满，皮毛质软细小，瘦肉率高，含脂量低，肉质鲜嫩，味美膻气少。从目前国际、国内形势看，我国黑山羊产业前景看好。据业内人士分析认为，我国黑山羊市场潜力巨大，出口创汇前景看好。当前国际大气候的变化为黑山羊产业发展带来了新的机遇，由于黑山羊品种不同，其品质也就各不相同，故品种的认定就自然成为我国黑山羊产业急需要解决的问题 四川省黑山羊资源比较丰富，过去的研究多为品种性能测定与评价等方面，对品种的起源、群体间的遗传差异、黑山羊的品种分化及相似性研究甚少。特别是利用分子标记研究黑山羊大群体的遗传结构和遗传多样性，尚未见有报道。 首先，我们参阅以往牛、山羊和绵羊等RAPD研究的文献，选取98个引物，经过反复筛选，从中挑选出30个重复性好的多态引物，运用构建总DNA基因池的方法，对黑山羊、南江黄羊、北川白山羊、成都麻羊4个山羊品种和藏绵羊进行RAPD分析，并重点进行了引物筛选和实验条件的优化，建立了适宜山羊RAPD的反应体系，计算了各品种间的遗传距离指数，探讨了彼此的亲缘关系。验证了实验方法本身的可靠性。 在上面实验的基础上，我们利用16条多态性好的引物，对分布于四川省不同区域的9个黑山羊种群共540个个体逐一进行了随机扩增多态DNA（RAPD）分析。结果表明：16条多态性引物在9个黑山羊种群中，共扩增出170个能完全重复且表现多态性的RAPD标记，各标记的大小在0.1-2.5kb之间。采用Nei
边银丙,熊巧玲[7]（2005）在《中国食用菌DNA分子标记研究的十年历程回顾》文中指出本文对我国十余年来DNA分子标记技术在食用菌遗传育种、菌株鉴定、基因定位和克隆、遗传图谱构建、遗传多样性、亲缘关系鉴定、线粒体遗传等研究中的应用概况进行了回顾,展望了分子标记在食用菌研究中的前景。
朱金秋[8]（2005）在《四川山（绵）羊品种随机扩增多态DNA分析》文中指出本论文利用RAPD技术对分布于四川各地5个具有代表性的山（绵）羊品种以及四川黑山羊4个不同的群体的遗传多样性进行了研究,分析了山（绵）羊品种间的亲缘关系、群体间的遗传多样性以及品种内雌雄群体的遗传差异。 参阅文献挑选80个随机引物,从中筛选出30个重复性好的多态引物,运用构建基因池的方法,对四川黑山羊、南江黄羊、北川白山羊、成都麻羊4个山羊品种和藏绵羊进行RAPD分析,并进一步对四川合江、会理、营山和江安四县的黑山羊个体共200只、南江黄羊个体13只以及北川白山羊个体17只的基因组DNA分别进行扩增,同时探讨了实验条件的优化,根据Nei氏公式计算品种间的遗传距离指数,UPGMA法构建树状聚类图,Shannon多样性指数计算群体的遗传多样性。 研究结果表明: 1.构建基因池和分别扩增个体基因组的方法均能很好地反映种群的遗传差异,RAPD技术可作为一种有效的分子标记用于山羊品种之间遗传亲缘关系的分析。 2.南江黄羊与成都麻羊的遗传距离最大（0.1348）,彼此亲缘关系更远;黑山羊与南江黄羊的遗传距离最小（0.0621）,亲缘关系较近;藏绵羊与各品种间的遗传距离都很大,亲缘关系远。 3.各品种内公羊和母羊之间存在一定的遗传差异,尤以黑山羊最为显着。
张丹,郑有良[9]（2004）在《生化标记和分子标记在蕈菌研究中的应用现状》文中认为本文介绍了目前在蕈菌研究中的酯酶同工酶标记 ,RAPD标记 ,RFLP标记 ,AFLP标记 ,简单重复序列标记和电泳核型等分子标记和生化标记在蕈菌遗传育种、菌株鉴定、遗传多样性研究、亲缘关系和基因定位等方面的研究、应用现状 ,包括原理、应用领域及最新研究进展。
马彬云,吴建平[10]（2004）在《遗传标记技术在动物育种中的研究进展》文中进行了进一步梳理随着生物科学的不断发展,遗传标记辅助选择（MAS）已经在动物改良中获得了较大的遗传进展,其中最关键的环节是识别有效的遗传标记,即这一标记应与控制这些数量性状的基因（QTL）处于连锁不平衡（linkage disequilibrium）状态。就目前遗传标记技术在动物遗传育种中的研究进展进行了综述,并展望了遗传标记技术在该领域的应用前景,以期引出这一技术可能存在的一些问题以供思考。
二、RAPD技术在羊遗传育种中的应用（论文开题报告）
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
本文主要提出一款精简64位RISC处理器存储管理单元结构并详细分析其设计过程。在该MMU结构中,TLB采用叁个分离的TLB,TLB采用基于内容查找的相联存储器并行查找,支持粗粒度为64KB和细粒度为4KB两种页面大小,采用多级分层页表结构映射地址空间,并详细论述了四级页表转换过程,TLB结构组织等。该MMU结构将作为该处理器存储系统实现的一个重要组成部分。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
三、RAPD技术在羊遗传育种中的应用（论文提纲范文）
（1）枣种质资源遗传多样性的分子评价及其核心种质的构建（论文提纲范文）
| 摘要 |
| Abstract |
| 1 引言 |
| 1.1 枣种质资源研究进展 |
| 1.1.1 枣种质资源的起源与演化 |
| 1.1.2 枣种质资源的分布 |
| 1.1.3 枣种质资源的调查、收集和保存 |
| 1.1.4 枣种质资源的评价 |
| 1.1.5 枣种质资源的分类与鉴定 |
| 1.1.6 枣种质资源的创新 |
| 1.2 植物核心种质研究进展 |
| 1.2.1 核心种质的概念、特征 |
| 1.2.2 核心种质的构建 |
| 1.2.3 核心种质的应用 |
| 1.2.4 核心种质研究概况 |
| 1.2.5 木本植物核心种质的构建 |
| 1.3 AFLP技术及其在果树研究中的应用 |
| 1.3.1 AFLP技术的原理及特点 |
| 1.3.2 AFLP技术在果树研究中的应用 |
| 1.4 SRAP技术及其在植物研究中的应用 |
| 1.4.1 SRAP技术的原理及特点 |
| 1.4.2 SRAP技术在植物学研究中的应用 |
| 1.5 本研究的目的意义 |
| 2 材料与方法 |
| 2.1 供试材料 |
| 2.2 主要仪器和试剂 |
| 2.2.1 主要仪器 |
| 2.2.2 试剂 |
| 2.3 试验方法 |
| 2.3.1 枣基因组DNA的提取 |
| 2.3.2 模板DNA纯度和浓度检测 |
| 2.3.3 AFLP分析 |
| 2.3.4 SRAP分析 |
| 2.3.5 扩增产物的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析 |
| 2.3.6 凝胶银染程序 |
| 2.3.7 引物筛选 |
| 2.3.8 结果统计与数据分析 |
| 2.3.9 供试枣品种核心种质的构建 |
| 2.4 试剂配制 |
| 3 结果与分析 |
| 3.1 枣基因组DNA的提取 |
| 3.2 供试材料的AFLP分析 |
| 3.2.1 AFLP引物筛选 |
| 3.2.2 枣种质的AFLP分析 |
| 3.2.3 基于AFLP标记的遗传多样性分析 |
| 3.2.4 基于AFLP标记的聚类分析 |
| 3.3 供试材料的SRAP分析 |
| 3.3.1 多态性分析 |
| 3.3.2 遗传相似性分析 |
| 3.3.3 基于SRAP标记的聚类分析 |
| 3.4 AFLP和SRAP数据的综合分析 |
| 3.4.1 AFLP和SRAP在枣种质间扩增结果的比较 |
| 3.4.2 AFLP和SRAP聚类分析结果的比较 |
| 3.4.3 AFLP和SRAP数据在枣种质分类中的综合利用 |
| 3.5 供试枣品种核心种质的构建 |
| 3.5.1 枣核心种质构建方法 |
| 3.5.2 各样本群的遗传多样性比较 |
| 3.5.3 取样比例的确定 |
| 4 讨论 |
| 4.1 AFLP和SRAP标记在枣种质资源研究中的应用 |
| 4.2 枣DNA水平的遗传多样性 |
| 4.3 几组枣品种或品系的亲缘演化关系 |
| 4.3.1 酥圆铃、核桃纹、老婆枣、大柿饼枣、延川狗头枣、圆铃新1号与圆铃的关系 |
| 4.3.2 磨盘枣与圆铃枣品种群的关系 |
| 4.3.3 义乌大枣、南京枣和宣城尖枣的关系 |
| 4.3.4 宁阳六月鲜、孔府酥脆枣和疙瘩脆的关系 |
| 4.3.5 龙枣和长红枣品种群的关系 |
| 4.3.6 串铃和长红枣品种群的关系 |
| 4.3.7 大名布袋枣与尜尜枣的关系 |
| 4.3.8 几个枣品种和金丝小枣品种群的关系 |
| 4.3.9 馒头枣、大荔鸡蛋枣、涪陵鸡蛋枣、临猗梨枣等的关系 |
| 4.3.10 敦煌大枣和临泽大枣的关系 |
| 4.3.11 临泽小枣和中宁小枣的关系 |
| 4.3.12 大王枣、薛城冬枣、雪枣的关系 |
| 4.3.13 赞新大枣和赞皇大枣的关系 |
| 4.3.14 泡泡红、串干、沙枣、新乐大枣和婆枣的关系 |
| 4.3.15 灵宝大枣和屯屯枣的关系 |
| 4.3.16 小平顶和朝阳圆枣的关系 |
| 4.3.17 三变红和胎里红的关系 |
| 4.3.18 蒲城晋枣和耙齿枣的关系 |
| 4.3.19 稷山圆枣和柳罐枣的关系 |
| 4.3.20 茶壶枣和扁核酸的关系 |
| 4.3.21 韩国枣品种的亲缘关系 |
| 4.4 枣的种下划分 |
| 4.5 枣核心种质的构建 |
| 4.5.1 构建核心种质的数据 |
| 4.5.2 核心种质的取样比例 |
| 4.5.3 核心种质构建的取样方法 |
| 4.5.4 核心种质的代表性、多样性和实用性 |
| 5 结论 |
| 参考文献 |
| 在读期间发表的学术论文 |
| 作者简历 |
| 致谢 |
| 附录 |
（2）RAPD技术在动物育种上的应用（论文提纲范文）
| 1 RAPD技术的原理 |
| 2 RAPD技术在动物遗传育种中的应用 |
| 2.1 研究群体的遗传分化 |
| 2.2 研究品种 (系) 亲缘关系 |
| 2.3 鉴定品种 (系) |
| 2.4 定位和连锁标记作图 |
| 2.5 寻找与生产性能或抗病力相关的遗传标记 |
| 2.6 性别鉴定 |
| 3 RAPD技术存在的问题 |
| 3.1 RAPD反应条件的改进 |
| 3.1.1 模板DNA浓度优化 |
| 3.1.2 引物浓度优化 |
| 3.1.3 dNTPs浓度优化 |
| 3.1.4 TaqDNA聚合酶浓度优化 |
| 3.1.5 退火温度优化 |
| 3.2 RAPD检测手段的改进 |
| 4 RAPD技术的应用前景 |
（3）RAPD技术在猪育种上的应用（论文提纲范文）
| 1 RAPD技术的原理 |
| 2 RAPD技术在猪遗传育种中的应用 |
| 2.1 研究猪群体的遗传分化 |
| 2.2 研究品种 (系) 亲缘关系 |
| 2.3 鉴定品种 (系) |
| 2.4 定位和连锁标记作图 |
| 2.5 寻找与生产性能或抗病力相关的遗传标记 |
| 2.6 性别鉴定 |
| 3 RAPD技术存在的问题 |
| 3.1 RAPD反应条件的改进 |
| 3.1.1 模板DNA浓度优化 |
| 3.1.2 引物浓度优化 |
| 3.1.3 dNTPs浓度优化 |
| 3.1.4 TaqDNA聚合酶浓度优化 |
| 3.1.5 退火温度优化 |
| 3.2 RAPD检测手段的改进 |
| 4 RAPD技术的应用前景 |
（4）分子标记技术在果树种质资源及遗传育种研究中的应用（论文提纲范文）
| 1 分子标记的类型和特点 |
| 1. 1 RFLP |
| 1. 2 RAPD |
| 1. 3 AFLP |
| 1. 4 SSR |
| 1. 5 SCAR |
| 1. 6 染色体原位杂交 |
| 2 分子标记在果树种质资源研究上的应用 |
| 2.1 种质资源的保存 |
| 2.2 品种鉴定 |
| 2.3 亲缘关系的演化及分类 |
| 2.4 遗传多样性分析 |
| 2.5 系谱分析 |
| 3 分子标记在果树遗传育种中的应用 |
| 3. 1 分子遗传图谱的构建和基因的定位 |
| 3.2 基因克隆 |
| 3.3 分子标记辅助选择育种 |
| 4 问题与展望 |
（5）中国主要山羊品种RAMP标记多态性的研究（论文提纲范文）
| 中文摘要 |
| 英文摘要 |
| 1 引言 |
| 1.1 研究目的和意义 |
| 1.2 主要研究内容 |
| 2 文献综述 |
| 2.1 羊毛纤维品质分析 |
| 2.1.1 羊毛纤维组织学构造 |
| 2.1.2 羊毛被毛纤维类型 |
| 2.1.3 羊毛纤维品质测试指标 |
| 2.2 遗传标记 |
| 2.2.1 分子遗传标记的概念及特点 |
| 2.2.2 分子标记的类型 |
| 2.2.3 RAPD标记 |
| 2.2.4 RAPD技术的应用 |
| 3 材料与方法 |
| 3.1试验材料 |
| 3.1.1试验用毛样 |
| 3.1.2试验用血样 |
| 3.1.3试验用随机引物 |
| 3.2主要仪器 |
| 3.3 主要试剂及其配制 |
| 3.3.1主要试剂 |
| 3.3.2主要试剂的配制 |
| 3.4试验方法 |
| 3.4.1主要测试项目 |
| 3.4.2血样采集方法 |
| 3.4.3全血基因组DNA的提取方法 |
| 3.4.4 DNA检测方法 |
| 3.4.5 DNA样品的稀释 |
| 3.4.6引物的稀释 |
| 3.4.7 PCR体系的建立方法 |
| 3.4.8 PCR产物的检测方法 |
| 3.4.9引物的筛选 |
| 3.4.10统计方法 |
| 4 结果与分析 |
| 4.1 羊毛品质分析 |
| 4.1.1 羊毛纤维直径 |
| 4.1.2 羊毛纤维长度 |
| 4.1.3 羊毛纤维净毛率 |
| 4.1.4 单位长度弯曲数 |
| 4.1.5 各性状间的表型相关 |
| 4.2 主要产毛性状的 RAPD标记 |
| 4.2.1 全血基因DNA检测结果 |
| 4.2.2 PCR体系的优化结果 |
| 4.2.3 引物筛选结果 |
| 4.2.4 个体 RAPD扩增结果分析 |
| 4.2.5 RAPD标记与产毛性状的相关分析 |
| 5 讨论 |
| 5.1 毛品质分析 |
| 5.1.1 关于羊毛纤维直径 |
| 5.1.2 关于羊毛纤维长度 |
| 5.1.3 关于羊毛纤维净毛率 |
| 5.1.4 关于弯曲频率及其与其他性状之间的相关分析 |
| 5.2 主要产毛性状的 RAPD标记 |
| 5.2.1 关于 RAPD技术 |
| 5.2.2 RAPD反应条件的优化 |
| 5.2.3 关于扩增图谱 |
| 5.2.4 2种群的遗传稳定性、遗传变异及亲缘关系的分析 |
| 5.2.5 部分产毛性状的辅助标记选择 |
| 6 结论 |
| 参考文献 |
| 致谢 |
| 作者简介 |
（6）四川各地黑山羊分子遗传特征研究（论文提纲范文）
| 图片目录 |
| 表格目录 |
| 中文摘要 |
| 英文摘要 |
| 文献综述 |
| 第一节 遗传标记研究进展 |
| 前言 |
| 1.1 遗传标记的分类 |
| 1.1.1 形态学标记 |
| 1.1.2 细胞遗传标记 |
| 1.1.3 生化遗传标记 |
| 1.1.4 分子遗传标记 |
| 1.2 分子标记的主要类型 |
| 1.2.1 限制性片段多态性(RFLP) |
| 1.2.2 随机扩增多态DNA(RAPD) |
| 1.2.3 扩增片段长度多态性(AFLP) |
| 1.2.4 单核苷酸多态性(SNP) |
| 1.2.5 微卫星(Microsatellite)DNA |
| 1.2.6 mtDNA标记 |
| 1.2.7 DNA指纹标记 |
| 1.2.8 ISSR(Inter Simple Sequence Repeats) |
| 1.2.9 PCR-SSCP标记 |
| 1.3 分子标记与数量性状位点的连锁分析方法 |
| 1.4 前景与展望 |
| 第二节 遗传标记在山(绵)羊遗传育种中的应用 |
| 2.1 遗传多样性方面 |
| 2.1.1 RFLP标记 |
| 2.1.1.1 利用RFLP标记在绵羊、山羊育种上的应用研究报道相对较多。 |
| 2.1.1.2 Beta酪蛋白全基因PCR-RFLP |
| 2.1.1.3 绵羊褪黑激素受体1a基因第二外显子PCR-RFLP分析 |
| 2.1.1.4 绵羊MHC-DRB3基因PCR-RFLP分析 |
| 2.1.1.5 BMPR-IB基因PCR-RFLP研究 |
| 2.1.2 RAPD标记 |
| 2.1.3 微卫星DNA |
| 2.1.4 小卫星DNA标记(Ministatellite DNA) |
| 2.1.5 AFLP遗传标记 |
| 2.2 MAS与QTL定位 |
| 第一章 引物筛选及四川几个山(绵)羊品种的RAPD分析 |
| 摘要 |
| 关键词 |
| 引言 |
| 1 材料与方法 |
| 1.1 试验材料 |
| 1.1.1 试验动物 |
| 1.1.2 试剂盒、工具酶和生化试剂 |
| 1.1.3 主要仪器 |
| 1.1.4 引物合成 |
| 1.2 试验方法 |
| 1.2.1 全血基因组DNA的抽提 |
| 1.2.2 基因池A和基因池B的制备 |
| 1.2.3 随机引物筛选 |
| 1.2.4 PCR实验条件优化 |
| 1.2.5 五个山(绵)羊基因池A的PCR扩增 |
| 1.2.6 五个山(绵)羊基因池B的PCR扩增 |
| 1.2.7 RAPD数据统计处理 |
| 2 试验结果 |
| 2.1 基因组DNA的抽提、检验 |
| 2.2 筛选之引物 |
| 2.3 优化的PCR反应条件 |
| 2.3.1 Taq酶浓度 |
| 2.3.2 引物浓度 |
| 2.3.3 Mg~(2+)浓度 |
| 2.3.4 模板浓度 |
| 2.3.5 4dNTP浓度 |
| 2.3.6 PCR循环数及其他条件 |
| 2.4 五个山(绵)羊品种间的遗传亲缘关系 |
| 2.5 五个山(绵)羊品种内公羊和母羊之间的遗传相似系数 |
| 2.6 各品种间的UPGMA聚类 |
| 3 讨论 |
| 3.1 随机引物的多态性 |
| 3.2 RAPD的可重复性 |
| 3.3 RAPD对近缘种山羊分析的可靠性 |
| 小结 |
| 参考文献 |
| 第二章 四川9个黑山羊种群的RAPD分析 |
| 摘要 |
| 关键词 |
| 引言 |
| 1 材料与方法 |
| 1.1 材料 |
| 1.1.1 试验动物 |
| 1.1.2 试剂 |
| 1.1.3 主要仪器 |
| 1.2 方法 |
| 1.2.1 随机引物的挑选 |
| 1.2.2 对所有样品进行逐一PCR扩增 |
| 1.2.3 数据分析 |
| 1.2.3.1 引物的多态性分析 |
| 1.2.3.2 群体的遗传多样性参数 |
| 1.2.3.2.1 群体杂合度(Nei’s基因多样度)： |
| 1.2.3.2.2 Shannon多态信息指数 |
| 1.2.3.2.3 群体基因分化系数 |
| 1.2.3.4 各群体间的遗传一致性和跗距离 |
| 1.2.3.4.1 Nei’s遗传相似性指数 |
| 1.2.3.4.2 Nei’s标准遗传距离 |
| 1.2.3.5 聚类分析 |
| 2 结果 |
| 2.1 各引物序列信息及扩增结果 |
| 2.2 各群体的杂合度和Shannon多态信息指数 |
| 2.3 群体基因分化系数 |
| 2.4 各群体间的遗传一致性和遗传距离 |
| 2.5 各群体的UPGMA聚类分析结果 |
| 3 讨论 |
| 3.1 黑山羊核DNA遗传多样性的高检出率 |
| 3.2 四川黑山羊整体的低分化 |
| 3.3 四川黑山羊亲缘关系与地理分布的一致性 |
| 小结 |
| 参考文献 |
| 第三章 黑山羊种群RAPD标记与黑山羊表型性状的相关分析 |
| 摘要 |
| 关键词 |
| 引言 |
| 1 材料与方法 |
| 1.1 材料 |
| 1.1.1 试验动物 |
| 1.1.2 试剂 |
| 1.1.3 仪器 |
| 1.1.4 引物 |
| 1.2 方法 |
| 1.2.1 分别对公羊和母羊总DNA进行逐一PCR扩增 |
| 1.1.2 数据分析 |
| 1.1.2.1 各性状的表型变异及相关分析 |
| 1.1.2.2 RAPD标记与性状间的关联分析 |
| 1.1.2.3 与性状真实关联的分子标记筛选 |
| 2 结果 |
| 2.1 各RAPD引物序列及扩增结果 |
| 2.2 各产区黑山羊间性状差异的方差分析 |
| 2.3 各性状的表型变异 |
| 2.4 性状间的表型相关 |
| 2.5 RAPD标记与性状间的关联分析 |
| 2.6 与性状真实关联的分子标记筛选结果 |
| 2.6.1 根据表型相关的显着性进行筛选 |
| 2.6.2 根据两独立样本间个体表型值的分布进行筛选 |
| 3 讨论 |
| 3.1 关于RAPD标记与性状的关联分析 |
| 3.2 RAPD标记对性状的效应 |
| 参考文献 |
| 第四章 四川黑山羊10个微卫星基因座遗传多态性研究 |
| 摘要 |
| 关键词 |
| 引言 |
| 1 材料与方法 |
| 1.1 材料 |
| 1.1.1 试验动物 |
| 1.1.2 试剂 |
| 1.1.3 主要仪器 |
| 1.2 方法 |
| 1.2.1 微卫星引物的筛选与合成 |
| 1.2.2 PCR扩增 |
| 1.2.3 数据分析 |
| 1.2.3.1 微卫星标记等位基因频率 |
| 1.2.3.2 多态信息含量(PIC) |
| 1.2.3.3 群体杂合度(H) |
| 1.2.3.4 有效等位基因数(Ne) |
| 1.2.3.5 群体间遗传距离和聚类 |
| 2 结果与分析 |
| 2.1 PCR扩增产物及电泳结果 |
| 2.2 等位基因及其频率 |
| 2.3 多态信息含量 |
| 2.4 群体杂合度 |
| 2.5 有效等位基因数 |
| 2.6 群体间的遗传距离和聚类 |
| 3 讨论 |
| 3.1 四川9个黑山羊种群的遗传多态性 |
| 3.2 黑山羊品种(群体)的等位基因及其频率 |
| 3.3 黑山羊品种(群体)聚类 |
| 小结 |
| 参考文献 |
| 第五章 四川各地黑山羊mtDNA分子遗传特征研究 |
| 摘要 |
| 关键词 |
| 引言 |
| 1 材料和方法 |
| 1.1 材料 |
| 1.1.1 试验动物 |
| 1.1.2 试剂 |
| 1.1.3 引物 |
| 1.1.4 主要仪器 |
| 1.2 方法 |
| 1.2.1 肝组织中分离线粒体 |
| 1.2.2 mtDNA的提取 |
| 1.2.3 mtDNA的纯化与检测 |
| 1.2.4 目的DNA片断的扩增 |
| 1.2.5 PCR产物的纯化与正反向测序 |
| 1.2.6 测序数据的处理 |
| 1.2.6.1 序列的CLUSTALW对位排列 |
| 1.2.6.2 分析软件(MEGA2.0)确定多态位点 |
| 1.2.6.3 分析软件(MEGA2.0)确定核苷酸总变异位点 |
| 1.2.6.4 分析软件(MEGA2.0)确定简约信息位点 |
| 1.2.6.5 DnaSP软件计算单倍型多样性 |
| 1.2.6.6 DnaSP软件计算种群内的核苷酸多样性 |
| 1.2.6.7 DnaSP软件计算种群间的序列歧异水平 |
| 1.2.6.8 Network4.1软件构建单倍型网络关系图 |
| 1.2.6.9 PAUP~*4.0b10构建单倍型邻接树 |
| 1.2.6.10 Arlequin 2.0进行核苷酸误配分析 |
| 2 结果 |
| 2.1 四川黑山羊的mtDNA变异 |
| 2.1.1 黑山羊mtDNA Dloop序列长度与碱基组成 |
| 2.1.2 黑山羊mtDNA Dloop序列的核苷酸多态位点变异 |
| 2.1.3 四川黑山羊mtDNA Dloop环单倍型 |
| 2.2.四川黑山羊种群mtDNA Dloop遗传结构 |
| 2.2.1 黑山羊mtDNA Dloop序列长度与碱基组成 |
| 2.2.2 黑山羊mtDNA Dloop序列的核苷酸多态位点变异 |
| 2.2.3 黑山羊mtDNA Dloop序列的核苷酸多态位点变异类型 |
| 2.2.4 黑山羊mtDNA Dloop环单倍型 |
| 2.3 四川黑山羊D Loop全序列单倍型网络图 |
| 2.4 系统发育关系树的构建 |
| 2.5 黑山羊群体扩张事件 |
| 2.6 30个序列一体碱基图 |
| 2.7 黑山羊种群内mtDNA Dloop序列的同源性比较 |
| 2.8 黑山羊同其他山羊mtDNA Dloop序列的聚类比较 |
| 2 .9 黑山羊同其他山羊品种间mtDNA Dloop序列的聚类 |
| 3 讨论 |
| 3.1 冷冻肝脏中mtDNA的抽提效果比较 |
| 3.2 四川黑山羊种群mtDNA丰富的遗传多样性 |
| 3.3 黑山羊种群间的遗传分化 |
| 3.4 mtDNA序列分析同RAPD分析的比较 |
| 参考文献 |
| 本学位论文研究结论 |
| 致谢 |
| 在校期间发表文章情况 |
（8）四川山（绵）羊品种随机扩增多态DNA分析（论文提纲范文）
| 中文摘要 |
| 英文摘要 |
| 前言 |
| 第一部分: 四川五个山(绵)羊品种亲缘关系分析 |
| 1 材料和方法 |
| 2 结果与分析 |
| 3 讨论与小结 |
| 第二部分: 四川四个黑山羊群体遗传多样性分析 |
| 1 材料和方法 |
| 2 结果与分析 |
| 3 讨论与小结 |
| 参考文献 |
| 文献综述 |
| 参考文献 |
| 致谢 |
| 在读期间发表文章 |
| 声明 |
（9）生化标记和分子标记在蕈菌研究中的应用现状（论文提纲范文）
| 1 同工酶标记 |
| 2 RAPD标记 |
| 2.1 菌株或种质鉴定 |
| 2.2 亲缘关系和遗传多样性研究 |
| 2.3 杂交种和融合子的鉴定 |
| 2.4 基因定位及遗传连锁图的构建 |
| 3 RFLP标记 |
| 4 AFLP标记 |
| 5 简单重复序列标记 |
| 6 电泳核型 |
（10）遗传标记技术在动物育种中的研究进展（论文提纲范文）
| 1 遗传标记技术的研究进展 |
| 1.1 遗传标记辅助选择 (MAS) |
| 1.2 用于MAS的遗传标记[9, 10, ] |
| 1.3 进行MAS的遗传标记技术[11, 12] |
| 2 遗传标记技术在动物遗传育种中的应用 |
| 2.1 动物品种、品系和类群的鉴定 |
| 2.2 QTL主基因的定位与遗传图谱的构建 |
| 2.3 动物遗传标记辅助选择 |
| 3 遗传标记在动物育种中的应用前景 |
| 3.1 标记动物个体、鉴别亲子关系、研究动物起源与演化 |
| 3.2 标记经济性状主效基因, 开展动物遗传标记辅助选择 |
| 3.3 开展动物杂种优势的研究 |
| 4 遗传标记技术应用于动物育种可能存在的问题 |
四、RAPD技术在羊遗传育种中的应用（论文参考文献）
- [1]枣种质资源遗传多样性的分子评价及其核心种质的构建[D]. 白瑞霞. 河北农业大学, 2008(08)
- [2]RAPD技术在动物育种上的应用[J]. 彭礼繁,罗光彬,陈浩杰. 吉林畜牧兽医, 2007(03)
- [3]RAPD技术在猪育种上的应用[J]. 彭礼繁,罗光彬,陈浩杰. 猪业科学, 2007(02)
- [4]分子标记技术在果树种质资源及遗传育种研究中的应用[J]. 徐崇志,廖胜刚. 塔里木大学学报, 2006(03)
- [5]中国主要山羊品种RAMP标记多态性的研究[D]. 马巍. 吉林农业大学, 2006(12)
- [6]四川各地黑山羊分子遗传特征研究[D]. 李力. 四川大学, 2006(03)
- [7]中国食用菌DNA分子标记研究的十年历程回顾[A]. 边银丙,熊巧玲. 首届海峡两岸食（药）用菌学术研讨会论文集, 2005
- [8]四川山（绵）羊品种随机扩增多态DNA分析[D]. 朱金秋. 四川大学, 2005(01)
- [9]生化标记和分子标记在蕈菌研究中的应用现状[J]. 张丹,郑有良. 天然产物研究与开发, 2004(06)
- [10]遗传标记技术在动物育种中的研究进展[J]. 马彬云,吴建平. 甘肃农业大学学报, 2004(01)